自從小丑皇被神圣天使獸驅(qū)逐到異世界之后,數(shù)碼世界逐漸恢復(fù)原有的相貌,而被選召的孩子們也回到了現(xiàn)實社會,然而當年千年獸突破的火之墻卻還留存著缺口,由于火之墻,是將數(shù)碼世界分為了兩個空間,而神圣天使獸所使用的天國之門,也是將小丑皇流放到了火之墻的另一面,在那一面小丑皇再一次遇見了自己的創(chuàng)造者,極惡魔王啟示錄獸!并繼承了他的意志,知道啟示錄獸又將從新進行復(fù)活的行動,接受了啟示錄獸僅存的一絲力量進化成了混沌小丑皇,通過火之壁的縫隙回到了數(shù)碼世界,并且成立了新的軍團,由于’選召者‘這個神秘的力量存在,害怕再一次被封印的啟示錄獸,想要徹底切斷數(shù)碼世界和現(xiàn)實世界的聯(lián)系,并阻止這些孩子的到來,或者來到之后將立刻消滅,于是讓混沌小丑皇在整個數(shù)碼世界布滿了眼線,并通過加強版的黑色齒輪,控制了很多數(shù)碼世界的數(shù)碼寶貝首領(lǐng)。
這一次被選召的孩子將遇見的是前所未有的困難。。。隨著這些新的被選召的孩子來到數(shù)碼世界,曾經(jīng)的被選召的孩子也一并傳送了過來,幫助這些新的孩子們一步步成長,也將和自己曾經(jīng)的數(shù)碼寶貝伙伴一同戰(zhàn)斗,共同阻止混沌小丑皇獸,并揭開復(fù)活啟示錄獸的陰謀。
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